蜘蛛香 (Valeriana jatamansi) 在我国西南和东北地区作为一种传统的草药用来治疗消化不良和风湿病。蜘蛛香在化学活性成分和药效方面都与缬草属其他药用植物存在较大差别。为了研究缬草属植物之间的亲缘关系以及寻找一种能够有效方便地将蜘蛛香与其他缬草属植物区别开的方法, 本文对5种缬草属药用植物的5S rDNA序列进行了扩增和测序。测序的结果表明扩增的5S rDNA片断, 长度在307 bp到355 bp之间。系统发育分析表明, 在所测试的5种缬草属植物中, 中国缬草 (V. pseudofficinalis) 与宽叶缬草 (V. officinalis var. latifolia) 亲缘关系最近, 而长序缬草 (V. hardwickii) 与其他4种材料的遗传距离最远。根据蜘蛛香5S rDNA序列的SNP位点设计了6条诊断型引物, 通过等位基因特异PCR (amplification refractory mutation system, ARMS) 分析, 其中一条引物可以将蜘蛛香与其他4种缬草属植物区别开。此外, 利用这条特异引物, ARMS技术还能够成功地鉴别出复方中药中是否含有蜘蛛香。由此可见, 这种方法不仅可以用以鉴别蜘蛛香的基原植物, 同时还能用于蜘蛛香商业产品的鉴别。